女性生殖系统的疾病即为妇科疾病，包括外阴疾病、阴道疾病、子宫疾病、输卵管疾病、卵巢疾病等。
常见的妇科疾病主要有以下几类：
生殖系统炎症：如外阴炎、前庭大腺炎、前庭大腺囊肿；阴道炎（滴虫性阴道炎、霉菌性阴道炎、老年性阴道炎、细菌性阴道炎）；宫颈炎（急、慢性宫颈炎，宫颈糜烂，宫颈息肉，宫颈肥大，宫颈腺囊肿，宫颈粘膜炎等）；盆腔炎（急性盆腔炎、慢性盆腔炎）。
性传播性疾病：淋病、梅毒、软下疳、生殖器尖锐湿疣、生殖器疱疹、艾滋病等。
女性生殖系统肿瘤：外阴肿瘤、阴道肿瘤、子宫颈肌瘤、子宫颈癌、卵巢良性肿瘤（卵巢囊肿、卵巢良性畸胎瘤）、卵巢癌、子宫肌瘤、子宫内膜癌、子宫肉瘤、输卵管肿瘤等。
子宫内膜异位症、子宫肌腺症。
月经病：功能性子宫出血、闭经、痛经、经前期紧张综合征、更年期综合征。
女性生殖器官发育异常：先天性无阴道、处女膜闭锁、卵巢发育异常等。
女性生殖器官损伤性疾病：子宫脱垂、阴道壁膨出、尿瘘等。
以上这些疾病一般为单一发生，很少会同时发生。
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